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通道鲶鱼基因组的第一个测序

发布时间:2019-01-11 19:02

        

 

 

 

     

  Waldbieser弥补说,这很主要,由于提高鲶鱼的发展速率,鱼片产量,肉质和抗病威力将使养鱼户收获颇丰。

  Waldbieser和WARU遗传学家Brian Bosworth比来利用Coco的基因组来判定Delta Select系列中单个鲶鱼之间DNA序列的变异 - 一种改良的鲶鱼系在WARU开辟供农人利用。“此刻咱们晓得DNA序列中遗传变异的位置,咱们将可以大概阐发分歧个别鲶鱼遗传的基因组的分歧部门,”Waldbieser说。“咱们能够识别这些细分,将它们传布给咱们的鱼群,并改善农人的肉类出产和出产效率。”

  Waldbieser利用一种称为“雌核发育”的特殊育种手艺来出产基因组供体Coco,因而她含有两个雷同DNA的其他植物 - 除了两个拷贝彻底不异。“我在Coco Chanel之后定名她,由于她是第1频道,”Waldbieser说。

  “这些序列就像拼图一样。在64个处置器的计较机事情站上花了2个月来对齐它们并发生基因拆卸配,”Waldbieser说。

  位于密西西比州斯通维尔的农业钻研办事(ARS)温水养殖钻研单元(WARU)的钻研协助鲶鱼出产者提高其产物的品质和数量。比来,一个由WARU分子生物学家Geoff Waldbieser和奥本大学科学家John Liu带领的团队为黑点鲶鱼制造了第一个基因组序列拆卸。它也是任何类型鲶鱼的第一个。

  细胞中DNA的总补体称为“基因组”,鲶鱼基因组与指点手册一样,蕴含制造和“操作”每条鱼所需的消息。鲶鱼基因组序列拆卸使科学家可以大概阅读每个鲶鱼的利用仿单,并寻找使一些植物发展得更快或更好地抵当疾病的差别。

  名为“Coco”的鱼位于任何鲶鱼物种的第一基因组序列的核心。鲶鱼是主要的炊事卵白质来历,是世界上第三大养殖鱼类。尽管已知有跨越2,500种鲶鱼具有,但黑点鲶鱼在美国水产养殖中占主导职位地方,占鱼类和海产物产量的60%以上。按照美国农业部国度农业统计局的数据,2015年美国鲶鱼种植者的产量发卖总额为3.61亿美元,比上年增加3%。

  Waldbieser与位于Stoneville的基因组学和生物消息学钻研部分以及马里兰州Beltsville的Bovine功效基因组学尝试室的ARS科学家竞争,从Coco的DNA中发生了大约8亿个DNA序列。

              

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